在分子生物學的眾多實驗中,RNA的提取是至關重要的一步,也是許多研究者的di一個挑戰。RNA的完整性、純度和濃度直接決定了后續實驗,如逆轉錄PCR、實時熒光定量PCR、RNA測序等的成敗。在眾多RNA提取方法中,基于“Triizol"(或其通用名“異硫氰酸胍-酚法")的一步提取法,因其高效、穩定和通用性,至今仍是實驗室中zui經典、zui廣泛應用的技術之一。
Triizol是一種單相、強變性劑的裂解溶液,其核心成分是苯酚和異硫氰酸胍。這種獨特的配方使其能夠同時實現多個目標:
強效裂解與變性:異硫氰酸胍是一種強烈的蛋白質變性劑,能迅速裂解細胞并滅活細胞內的RNase(核糖核酸酶),這是保護脆弱RNA不被降解的關鍵。
維持核酸完整性:在變性條件下,核酸酶失去活性,從而確保了RNA在提取過程中的完整性。
實現多組分分離:該方法的精妙之處在于,在加入氯仿后,溶液會分相,從而實現RNA、DNA和蛋白質的分離。
基本原理簡述:
• 均質化階段:樣品在Triizol試劑中被充分勻漿,細胞wan全裂解,核酸與蛋白質分離并被變性。
• 分相階段:加入氯仿后,混合物離心分為三層:
上層水相:包含RNA。
中間層:主要為DNA和變性的蛋白質。
下層有機相:包含蛋白質、脂質等。
• RNA沉淀與洗滌:吸取上層水相,加入異丙醇即可將RNA沉淀出來。通過乙醇洗滌去除雜質,最后溶解于無RNase水中,即可得到高純度的總RNA。
Triizol法設計的初衷是用于總RNA的提取,但其強大的裂解和分相能力使其具備了更廣泛的用途。
主要優勢:
高得率與完整性:尤其適用于難以提取的組織(如富含脂肪的組織、植物組織)或少量樣本,能有效獲得完整性好的RNA。
適用范圍廣:幾乎適用于所有生物樣本,包括動物組織、細胞、植物組織、細菌、酵母等。
一管多用:在提取RNA的同時,可以保留中間層的DNA和下層有機相的蛋白質,用于后續的DNA克隆、蛋白質印跡等分析,實現“一管樣本,多組學產出"。
成本效益高:相較于許多商品化的柱式提取試劑盒,該方法在處理大量樣本時更具成本優勢。
由于其zhuo越的性能,Triizol法成為了眾多生命科學實驗研究的基石。
這是Triizol法最核心的應用領域。高質量的RNA是進行準確基因表達分析的前提。
實時熒光定量PCR:提取的RNA經逆轉錄后,用于qPCR分析,精確檢測特定基因的表達水平。RNA的純度至關重要,任何污染物都可能影響逆轉錄效率和PCR擴增的特異性。
Northern Blot:需要完整的、未降解的RNA來準確顯示目標RNA分子的大小和豐度。
RNA測序:作為目前轉錄組研究的主流技術,RNA-Seq對RNA的完整性要求ji高。使用Triizol法提取的、RNA完整性數值高的RNA是獲得可靠測序數據的關鍵。
富含RNase的組織:如胰腺、脾臟等,Triizol中的強變性劑能瞬間滅活這些組織中的高活性RNase。
植物組織:植物細胞含有堅硬的細胞壁和大量的多糖、多酚等次生代謝物。Triizol能有效破碎細胞并溶解這些干擾物,通過分相將其與RNA分離。
脂肪組織:傳統的柱式法容易因脂質堵塞而失敗,Triizol法則能很好地處理高脂樣本。
在現代系統生物學研究中,常需要從同一份樣本中獲取不同層面的信息(如轉錄組和蛋白質組)。
同步提取RNA與蛋白質:使用Triizol法,研究人員可以在提取總RNA后,從下層有機相中進一步沉淀回收總蛋白,用于后續的蛋白質印跡、質譜分析等。這保證了用于不同組學分析的樣本來源wan全一致,減少了樣本間誤差。
在病毒學研究和臨床診斷中,如流感病毒、新型guan狀病毒等的檢測,常需要從咽拭子、組織培養液等樣本中直接提取病毒RNA。Triizol法能有效裂解病毒外殼,釋放并保護病毒RNA,為后續的RT-PCR檢測提供模板。
盡管Triizol法非常強大,但要獲得理想的結果,必須注意以下環節:
無RNase操作:整個操作過程應在專用區域進行,使用無RNase的耗材和溶液,避免外源性RNase污染。
快速操作:樣本裂解后應盡快完成后續步驟,縮短RNA暴露在潛在風險中的時間。
分相與轉移:吸取上層水相時務必小心,切勿觸碰到中間層,否則會引入DNA和蛋白質污染。
充分洗滌與干燥:乙醇洗滌后,讓RNA沉淀適當干燥以che底去除乙醇,但切忌過度干燥,否則RNA將極難溶解。
Triizol法作為一種經久不衰的分子生物學基礎技術,以其強大的裂解能力、出色的RNA保護效果以及“一管三用"的獨特優勢,在基因表達分析、多組學研究和各類復雜樣本的處理中扮演著不可或替代的角色。掌握其原理和操作細節,是每一位從事RNA相關研究的科研人員bi備的基本功。盡管后續發展出了許多便捷的柱式法,但Triizol法在追求高得率、高完整性和多組分同步提取的應用場景中,依然占據著無可動搖的地位。
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